实验室资源

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    功能性长非编码RNA预测平台-EVlncRNA-Dpred

    发布日期:2024-01-22

    https://www.sdklab-biophysics-dzu.net/EVlncRNA-Dpred/index.html

    长非编码RNA (lncRNA)在几乎所有的生物过程和疾病中都起着至关重要的作用。人们开发了许多算法来区分转录组数据中的lncRNA和mRNA,并促进了超过60万个lncRNA的发现。然而,只有一小部分 (<1%)的lncRNA (约4000)被低通量实验进一步验证。因此,有必要开发计算工具来优先考虑那些潜在的功能lncRNA。EVlncRNA-Dpred是使用深度学习算法发展的预测潜在功能性lncRNA的方法,分别为人、小鼠和植物训练了三个独立的模型。EVlncRNA-Dpred比之前基于支持向量机的模型 (EVlncRNA-pred)有了很大的改进,可为后续lncRNA功能的实验研究提供参考。

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