http://biophy.dzu.edu.cn:8080/CNumD/input.jsp

氨基酸残基的组成和序列顺序是描述蛋白质序列的两个最重要的特征。图形表示有助于生物序列的可视化，并产生生物学上有用的数值描述符。我们提出了一个新的圆柱形表示，将20种氨基酸残基类型放在一个圆和序列位置沿z轴。这种表示法可以同时显示氨基酸的组成和序列顺序。在圆柱形模型的基础上，开发了10个数值描述符和1个加权数值描述符来定量描述蛋白质序列的内在特性。将其应用于9种ND5蛋白的相似度/不相似度分析，结果表明这些数值描述子比几种经典的数值矩阵更有效。因此，这里得到的圆柱形表示为可视化和描述蛋白质序列提供了一个新的有用的工具(Journal of Chemical Information and Modeling, 2015)。