曹赞霞博士课题获国家自然科学基金项目批准立项

发布日期:2011-10-19

近日,科研处传来喜讯,实验室青年教师曹赞霞博士主持的课题《基于分子模拟方法研究环境因素和相互作用蛋白如何调节α-synuclein蛋白的异常聚集》经过层层审批,获得国家自然科学青年科学基金项目立项,项目批准号31000324,获资助19万元。

本课题基于环境因素和相互作用蛋白是影响α-synuclein蛋白异常聚集的重要因素。但是通过实验手段很难在微观尺度上分析这两种因素如何调节α-synuclein蛋白的异常聚集。针对实验研究的局限性,本项目基于DFIRE势函数构建蛋白质相互作用模型,采用分子动力学和粗粒化模型相结合的方法对调节α-synuclein异常聚集的上述因素进行研究。

研究重点是:首先基于少量的实验数据和势函数DFIRE,优化适用于这类蛋白的参数,建立蛋白质-蛋白质相互作用模型结构,把已有实验数据作为约束,利用多副本交换的分子动力学模拟方法提高采样效率,系统研究这些蛋白之间相互作用特征以及作用位点残基的特征;另一方面,优化结合分子动力学与各种粗粒化模型,系统研究环境因素和相互作用蛋白对α-synuclein异常聚集的调节作用。这些研究能够在微观尺度上加深对共核蛋白病的发病机制、关键残基、关键蛋白的认识,为新药开发奠定基础。

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