1. 肿瘤类器官lncRNA图谱及标志物挖掘研究，国家自然科学基金项目，2024-2027，49万
2. 三维纳米聚合物的原位自组装及其单细胞生物传感应用，国家自然科学基金项目，2024-2026，30万
3. 介导马铃薯青枯病抗性lncRNA的鉴定和机制研究，国家自然科学基金项目，2024-2026，30万
4. 硒和蚯蚓联合增强黑麦草生物修复酸性镉污染土壤的机制研究，国家自然科学基金项目，2024-2026，30万
5. 内置“热点”三维等离激元阵列增强拉曼及其机理研究，国家自然科学基金项目，2024-2026，30万
6. 应用于肿瘤标志物检测的浮栅型二硫化钼场效应晶体管生物传感器，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
7. 双发射金纳米簇基有机框架材料的合成及其在肿瘤标志物顺序检测中的应用，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
8. 二分散环形高分子熔体的链尺寸和动力学行为，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
9. NSF及其抑制蛋白调节植物根系发育的分子机理研究，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
10. 结合肠道菌群的结直肠癌肿瘤微环境分型及预后研究，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
11. 多级孔结晶型复合质子交换膜的制备及性能研究，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
12. 硫酸盐还原菌识别定位碳钢的趋向系统在细菌腐蚀过程中的作用，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
13. 感病基因StERF5调控马铃薯对青枯菌免疫应答的机理研究，山东省自然科学基金项目，2024-2026，15万
14. 电子俘获材料设计及其实现新型智能化数码光存储技术的研究，山东省自然科学青年项目，2023-2025， 15万
15. 猪圆环病毒2型疫苗免疫应答相关肠道菌群挖掘、作用机制及应用，山东省自然科学面上项目，2023-2025， 10万
16. 基于DNA纳米结构探针的一体化荧光适配体传感器用于牛奶中抗生素残留的检测研究，山东省自然科学面上项目，2023-2025， 10万
17. 石墨烯等离激元增强光纤微FET监测类器官标志物及其机理研究，国家自然科学面上项目，2023-2026， 55万
18. 用于转光膜的Ti3+掺杂铝酸盐红光–近红外发光材料及其发光机理研究，国家自然科学青年项目，2023-2025， 30万
19. 基于机器学习的增强模拟研究I型毒素蛋白-细胞膜的作用机制，国家自然科学基金面上项目，2022-2025，58万
20. 面向单细胞RNA测序数据的深度迁移模型与细胞通信网络研究，国家自然科学基金重点项目子课题，2022-2025，100万
21. 功能性LncRNA固有属性与互作特征研究，国家自然科学基金面上项目，2021-2024，64万
22. 融合多组学数据的原核基因组肽编码sORFs多维特征挖掘及预测，国家自然科学基金面上项目，2018-2021，65万
23. 长非编码RNA序列结构特征信息挖掘及其预测方法研究，国家自然科学基金面上项目，2017-2020，65万
24. 肿瘤靶向穿膜肽的选择性跨膜分子机制及其设计研究，国家自然科学基金面上项目，2017-2020，58万
25. 固有无序蛋白质（IDPs）特征信息挖掘及其预测方法发展，国家自然科学基金面上项目，2013-2016，81万
26. 节水栽培模式下小麦胚乳蛋白体发育与籽粒谷蛋白大聚合体形成的关系机制研究，国家自然科学基金面上项目，2013-2016，85万
27. 力学刺激下心肌成纤维细胞在细胞外基质方面的响应及生物活性，国家自然科学基金面上项目，2012-2015，63万
28. 热释电调控等离激元光腔增强拉曼及其机理研究，国家自然科学青年项目，2022-2024，30万
29. 基于固体膜微电极的电位传感技术研究，国家自然科学青年项目，2022-2024，30万
30. 植物糖信号转导新型调控因子的鉴定与功能机制研究，国家自然科学青年项目，2021-2023，24万
31. 疾病相关固有无序蛋白α-synuclein和p53结构与功能特性的计算机模拟研究，国家自然科学基金面上项目，2010-2012，28万
32. 褐藻NB-ARC类抗病基因家族的进化特征与功能解析，国家自然科学青年项目，2021-2023，24万
33. 希瓦氏菌群体感应信号分子特异性结合蛋白的结构及功能研究，国家自然科学青年项目，2018-2021, 25万
34. 戊糖乳杆菌HC-2与副溶血弧菌竞争对虾肠道粘附位点的相关基因挖掘及其作用机理研究，国家自然科学青年项目，2018-2021，24万
35. 潜在功能性长非编码RNA预测算法研究及应用，国家自然科学青年项目，2018-2021，23万
36. 淡水溶藻菌群体感应相关基因挖掘及其功能机理研究，国家自然科学基金，2020-2022，14.9万
37. 内生真菌和丛枝菌根真菌的互作对盐碱土改良的植物和土壤效应研究，国家自然科学青年项目，2021-2023，24万
38. 基于多组学数据解析冬眠期高山倭蛙耐受结冰的分子机制，国家自然科学青年项目，2021-2023，24万
39. 中国纹卷蛾族（鳞翅目：卷蛾科）分类修订及系统发育研究，国家自然科学青年项目，2021-2023，24万
40. 应用于生物传感的脉冲涡旋晶格刻蚀图案化石墨烯研究，国家自然科学青年项目，2018-2020，24万
41. 结合关联分析与转录组测序发掘野生二粒小麦条锈病抗性基因，国家自然科学青年项目，2018-2020，25万
42. 量子度量学在生物磁感应中的应用，国家自然科学青年项目，2018-2020，25万
43. 碱基金属-有机框架材料的合成、表征及药物运输作用的研究，国家自然科学青年项目，2018-2020，23万
44. 用于定量分析的石墨烯/金属纳米阵列增强拉曼基底的研究，国家自然科学基金青年项目，2017-2019，22万
45. Tip49a/Tip49b及其相关复合物的冷冻电镜结构研究，国家自然科学基金青年项目，2016-2018，20万
46. DNA G-quadruplex折叠热力学和动力学的多尺度模拟研究，国家自然科学基金青年项目，2016-2018，20万
47. 基于复合体结构预测的全基因组RNA结合蛋白发现新方法及其应用, 国家自然科学应急管理项目，2016-2016，20万
48. 蛋白-药物小分子解离过程的动力学研究，国家自然科学青年项目，2015-2017，21万
49. 基于不同类型基因组蛋白质编码基因共性信息挖掘的微生物基因组重注释，国家自然科学青年项目，2014-2016，25万
50. 量子点耦合系统的输运及耗散动力学，国家自然科学青年项目，2014-2016，25万
51. 深海放线菌Streptomyces sp.SCSIO 3406来源的海酮霉素的生物合成研究，国家自然科学青年项目，2014-2016，25万
52. 固有无序蛋白多维特征挖掘及预测，山东省自然科学基金重点项目，2016-2019，30万
53. “山东省泰山学者海外特聘教授”专项资金，山东省人民政府，2015-2020，200万（周耀旗）
54. “山东省泰山学者青年专家”专项资金，山东省人民政府，2016-2021，100万（宋峰）
55. “山东省泰山学者青年专家”专项资金，山东省人民政府，2019-2024，100万（许士才）
56. 生物大分子体系前沿交叉研究创新团队，山东省高等学校青创人才引育计划，160万（曹赞霞）
57. 生物大分子体系前沿交叉研究创新团队，山东省高等学校青创人才引育计划，200万（周百灵）
